اعلام جامعة بابل | رسالة ماجستير في كلية تكنولوجيا المعلومات تبحث تنبؤ مواقع الارتباط مع بروتين عامل النسخ

رسالة ماجستير في كلية تكنولوجيا المعلومات تبحث تنبؤ مواقع الارتباط مع بروتين عامل النسخ

نشر بواسطة : ضحى فاضل عباس

تاريخ الخبر : 26/8/2025 38:57:05 PM

عدد المشاهدات : 151

رسالة ماجستير في كلية تكنولوجيا المعلومات تبحث تنبؤ مواقع الارتباط مع بروتين عامل النسخ من بيانات تسلسل الحمض النووي باستخدام تقنيات التعلم الآلي

ضحى فاضل عباس
شهد قسم البرمجيات في كلية تكنولوجيا المعلومات – جامعة بابل مناقشة رسالة ماجستير للطالبة شهد رائد هادي بعنوان "تنبؤ مواقع الارتباط مع بروتين عامل النسخ من بيانات تسلسل الحمض النووي باستخدام تقنيات التعلم الآلي" ، وذلك بإشراف الأستاذ المساعد الدكتورة سرى زكي ناجي جرت المناقشة في تمام الساعة التاسعة من صباح يوم الثلاثاء الموافق 26/8/2025 على قاعة المؤتمرات في الكلية .

تناولت الرسالة موضوع تنظيم التعبير الجيني بوصفه عملية أساسية في الأنظمة البيولوجية، تتم من خلال التفاعلات بين عوامل النسخ و التسلسلات الجينية المحددة المعروفة بمواقع ارتباط عوامل النسخ، والتي غالبا ما تقع في مناطق المحفزات وتؤدي دورا مهما في تنشيط أو تثبيط عملية نسخ الجينات.
أوضحت الباحثة أن الطرق التجريبية التقليدية لاكتشاف مواقع ارتباط عوامل النسخ تواجه تحديات كبيرة، منها ارتفاع التكاليف وكثرة الجهد اليدوي المطلوب والحاجة إلى موارد حسابية ضخمة. وبالمقابل، توفر الأساليب الحاسوبية بدائل فعالة ودقيقة وقابلة للتوسع وبتكلفة منخفضة عند التعامل مع البيانات الجينومية واسعة النطاق.
اعتمدت الرسالة على نموذج تعلم عميق للتنبؤ بعوامل النسخ ومواقع ارتباطها في تسلسلات الحمض النووي لنبات Arabidopsis thaliana المستمدة من قاعدة بيانات AGRIS. خضعت البيانات لعمليات معالجة مسبقة لإزالة الضوضاء والتكرار، ومن ثم تم تمثيلها باستخدام تقنيات مثل k-mer و One-Hot Encoding.
بُني النموذج على شبكة عصبية التفافية (CNN) مدمجة مع آلية الانتباه (Attention Mechanism) لتعزيز دقة التنبؤ عبر تركيز النموذج على المناطق ذات الأهمية البيولوجية. تضمن هيكل النموذج قسمين أساسيين: الأول للتنبؤ بمواقع الارتباط، والثاني لتحديد عوامل النسخ المرتبطة بها. ومن خلال التجارب والتحسينات، تم اعتماد عشرة مواقع ارتباط ممثلة من أصل 471 موقعًا فريدًا لتدريب النموذج وتقييم أدائه، بما يحقق التوازن بين التنوع والقدرة على التعميم.

ت	اسماء اعضاء لجنة المناقشة	اللقب العلمي	الاختصاص الدقيق	مكان العمل	المنصب
1	د. توفيق عبد الخالق عباس	استاذ	معالجة صور	جامعة بابل / كلية تكنولوجيا المعلومات	رئيساً
2	د. عادل عبدالوهاب غيدان	استاذ مساعد	معلوماتية الحيوية	جامعة ديالى / كلية العلوم	عضوا
3	د. مهند محمد جاسم	مدرس	ذكاء اصطناعي و معلوماتية الحيوية	جامعة بابل / كلية تكنولوجيا المعلومات	عضوا
4	د. سرى زكي ناجي	استاذ مساعد	ذكاء اصطناعي و معلوماتية الحيوية	جامعة بابل / كلية تكنولوجيا المعلومات	عضوا و مشرفا